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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
05/09/2005 |
Data da última atualização: |
18/05/2022 |
Autoria: |
NESHIC, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A. TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. |
Título: |
The Diamond STING Server. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
Nucleic Acids Research, v. 33, n. 2, p. W29-W35, July 2005. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Supplement. |
Conteúdo: |
Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new functionalities by both providing more structure parameters to the STING Database and by improving/expanding the interface for enhanced data handling. The integration among the STING components has also been improved. A new key feature is the ability of the STING server to handle local files containing protein structures (either modeled or not yet deposited to the Protein Data Bank) so that they can be used by the principal STING components: JavaProtein Dossier (JPD) and STING Report. The current capabilities of the new STING version and a couple of biologically relevant applications are described here. We have provided an example where Diamond STING identifies the active site amino acids and folding essential amino acids (both previously determined by experiments) by filtering out all but those residues by selecting the numerical values/ranges for a set of corresponding parameters. This is the fundamental step toward a more interesting endeavor?the prediction of such residues. Diamond STING is freely accessible at http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br and http://trantor.bioc.columbia.edu/SMS. |
Palavras-Chave: |
Diamond STING; JavaProtein Dossier; Protein structures; STING. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/178422/1/ID-25540.pdf
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Marc: |
LEADER 02300naa a2200385 a 4500 001 1186091 005 2022-05-18 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNESHIC, G. 245 $aThe Diamond STING Server.$h[electronic resource] 260 $c2005 500 $aSupplement. 520 $aDiamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new functionalities by both providing more structure parameters to the STING Database and by improving/expanding the interface for enhanced data handling. The integration among the STING components has also been improved. A new key feature is the ability of the STING server to handle local files containing protein structures (either modeled or not yet deposited to the Protein Data Bank) so that they can be used by the principal STING components: JavaProtein Dossier (JPD) and STING Report. The current capabilities of the new STING version and a couple of biologically relevant applications are described here. We have provided an example where Diamond STING identifies the active site amino acids and folding essential amino acids (both previously determined by experiments) by filtering out all but those residues by selecting the numerical values/ranges for a set of corresponding parameters. This is the fundamental step toward a more interesting endeavor?the prediction of such residues. Diamond STING is freely accessible at http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br and http://trantor.bioc.columbia.edu/SMS. 653 $aDiamond STING 653 $aJavaProtein Dossier 653 $aProtein structures 653 $aSTING 700 1 $aBORRO, L. C. 700 1 $aHIGA, R. H. 700 1 $aKUSER, P. R. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. 700 1 $aFRANCO, E. H. 700 1 $aKRAUCHENCO, J. N. 700 1 $aFILETO, R. 700 1 $aRIBEIRO, A. A. 700 1 $aBEZERRA, G. B. 700 1 $aVELLUDO, T. M. 700 1 $aJIMENEZ, T. S. 700 1 $aFURUKAWA, N. 700 1 $aTESHIMA, H. 700 1 $aKITAJIMA, K. 700 1 $aBAVA, A. 700 1 $aSARAI, A. TOGAWA, R. C. 700 1 $aMANCINI, A. L. 773 $tNucleic Acids Research$gv. 33, n. 2, p. W29-W35, July 2005.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Registro |
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Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
05/12/2011 |
Data da última atualização: |
11/04/2018 |
Autoria: |
LENA, B. P.; FLUMIGNAN, D. L.; FARIA, R. T. |
Afiliação: |
Bruno Patias Lena, Universidade de São Paulo/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/Departamento de Engenharia de Biossistem; Danilton Luiz Flumignan, Universidade de São Paulo/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/Departamento de Engenharia de Biossistem; Rogério Teixeira de Faria, Instituto Agronômico do Paraná. |
Título: |
Evapotranspiração e coeficiente de cultivo de cafeeiros adultos. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 8, p. 905-911, ago. 2011. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Evapotranspiration and crop coefficient of adult coffee trees. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi determinar a evapotranspiração (ET) de cafeeiros adultos, irrigados por aspersão e gotejamento, e não irrigados, bem como os coeficientes de cultivo (Kc) de cafeeiros sob os dois regimes hídricos. O experimento foi realizado em Londrina, PR, com cafeeiros da cultivar Iapar 59, com cinco e seis anos de idade, de setembro de 2006 a agosto de 2008. A evapotranspiração foi medida por cinco lisímetros de pesagem, dos quais dois irrigados por aspersão, um por gotejamento e os outros dois sem irrigação. A irrigação foi aplicada, em média, duas vezes por semana, para manter o solo com umidade próxima à de capacidade de campo. O coeficiente de cultivo foi determinado pela razão entre a ET das plantas dos tratamentos irrigados e a evapotranspiração de referência (ETo). Os cafeeiros adultos apresentaram valor médio de ET mais elevado no tratamento irrigado por aspersão (3,2 mm dia-1), em comparação aos de outros tratamentos, que apresentaram médias equivalentes entre si (2,8 mm dia-1). A mesma tendência foi observada para Kc, em razão da relação ET e ETo, com valor médio maior para o tratamento irrigado por aspersão (1) e menor para o gotejamento (0,88). |
Palavras-Chave: |
Demanda hídrica; Water demand. |
Thesagro: |
Coffea Arábica; Irrigação; Lisímetro. |
Thesaurus NAL: |
Irrigation; Lysimeters. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/49149/1/46n08a17.pdf
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Marc: |
LEADER 01959naa a2200241 a 4500 001 1908426 005 2018-04-11 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLENA, B. P. 245 $aEvapotranspiração e coeficiente de cultivo de cafeeiros adultos. 260 $c2011 500 $aTítulo em inglês: Evapotranspiration and crop coefficient of adult coffee trees. 520 $aO objetivo deste trabalho foi determinar a evapotranspiração (ET) de cafeeiros adultos, irrigados por aspersão e gotejamento, e não irrigados, bem como os coeficientes de cultivo (Kc) de cafeeiros sob os dois regimes hídricos. O experimento foi realizado em Londrina, PR, com cafeeiros da cultivar Iapar 59, com cinco e seis anos de idade, de setembro de 2006 a agosto de 2008. A evapotranspiração foi medida por cinco lisímetros de pesagem, dos quais dois irrigados por aspersão, um por gotejamento e os outros dois sem irrigação. A irrigação foi aplicada, em média, duas vezes por semana, para manter o solo com umidade próxima à de capacidade de campo. O coeficiente de cultivo foi determinado pela razão entre a ET das plantas dos tratamentos irrigados e a evapotranspiração de referência (ETo). Os cafeeiros adultos apresentaram valor médio de ET mais elevado no tratamento irrigado por aspersão (3,2 mm dia-1), em comparação aos de outros tratamentos, que apresentaram médias equivalentes entre si (2,8 mm dia-1). A mesma tendência foi observada para Kc, em razão da relação ET e ETo, com valor médio maior para o tratamento irrigado por aspersão (1) e menor para o gotejamento (0,88). 650 $aIrrigation 650 $aLysimeters 650 $aCoffea Arábica 650 $aIrrigação 650 $aLisímetro 653 $aDemanda hídrica 653 $aWater demand 700 1 $aFLUMIGNAN, D. L. 700 1 $aFARIA, R. T. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 8, p. 905-911, ago. 2011.
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